長崎市坂本町の長崎大学医学部構内に、レンガ造り２階建のポンペ会館がある。

長崎医学同窓会が長崎大学医学部創立１００周年、原爆復興１０周年を記念して、　同窓会会員、医学部教官等多数の方々の募金により、平成４年８月３１日に建設　したものである。

この会館は、日本に初めて近代西欧医学を組織的に導入した長崎大学医学部の創立者ポンペ　ファン　メールテルフォールトにちなみポンペ会館と命名され、日蘭交流等医学資料展示室、教育研修のための会場等を備えている。

総面積1090平方メートル　クラシック調2階建　2階両側煉瓦調タイル張り　屋根黒色瓦　2階両側の窓にステンドグラス（南側は咸臨丸と養生所、北側は鳩）